Kualitas sampel
Jasa QC DNA & RNA: Qubit dan integritas sampel
Ketahui kondisi sampel sebelum melangkah ke library preparation atau sequencing. GSN membantu mengoordinasikan pengukuran DNA/RNA dan pemeriksaan integritas sesuai kebutuhan proyek.
Kuantitas dan integritas menjawab pertanyaan berbeda
Kuantifikasi fluorometrik seperti Qubit membantu mengukur konsentrasi asam nukleat sesuai assay. Pemeriksaan integritas seperti TapeStation memberikan informasi kondisi atau distribusi ukuran fragmen sesuai metode yang digunakan.
Pilih pemeriksaan berdasarkan keputusan yang ingin diambil. DNA untuk short reads, DNA berukuran panjang, dan RNA untuk ekspresi gen dapat membutuhkan kombinasi parameter yang berbeda.
Hasil QC perlu dibandingkan dengan kebutuhan aplikasi
Tidak ada satu nilai konsentrasi, DIN, atau RIN/RINe yang dapat menjadi syarat universal untuk semua jenis sequencing. Penilaian harus mengikuti material, produk, serta metode library yang dipilih.
Jika sampel sudah pernah diperiksa, sertakan hasil lengkap dan tanggal pengukuran. Informasi volume tersisa, larutan elusi, metode ekstraksi, serta riwayat penyimpanan membantu tim memahami kondisi material saat ini.
Sepakati pemeriksaan dan langkah berikutnya
Penawaran QC perlu menyebutkan pemeriksaan yang dikerjakan dan keluaran yang diterima. Hasil dapat digunakan untuk meninjau kesiapan sequencing, kebutuhan evaluasi tambahan, atau kemungkinan mengulang preparasi dengan material baru.
QC adalah dasar pengambilan keputusan, bukan jaminan seluruh tahapan berikutnya akan berhasil. Bila suatu parameter belum sesuai, tindakan lanjutan dibahas berdasarkan hasil, kebutuhan metode, dan ketersediaan sampel.
Gunakan kode sampel yang konsisten antara tabung dan daftar pengiriman. Sebelum mengirim, konfirmasikan wadah, volume yang diperlukan untuk pengujian, kondisi transport, dan penanganan sisa material.
Keluaran yang dapat disepakati
- Hasil kuantifikasi sesuai assay yang dipesan
- Profil integritas bila pemeriksaan tersebut dipilih
- Ringkasan hasil per identitas sampel
- Pembahasan kebutuhan tindak lanjut proyek
Pemeriksaan dan analisis yang disertakan mengikuti penawaran yang disetujui untuk proyek Anda.
Pertanyaan umum
Hal yang sering ditanyakan
Apakah hasil Qubit cukup untuk HiFi?
Kuantitas dan integritas merupakan aspek berbeda. Kebutuhan evaluasi fragmen DNA untuk HiFi harus mengikuti workflow yang dipilih; konsentrasi saja tidak cukup untuk menilai semua aspek tersebut.
Apakah setiap sampel mendapat nilai RIN/RINe atau DIN?
Indikator yang tersedia bergantung pada jenis sampel dan assay. Konfirmasikan metode serta format hasil yang sesuai sebelum memesan pemeriksaan.
Bolehkah hanya mengirim hasil QC yang sudah ada?
Hasil sebelumnya dapat digunakan untuk peninjauan awal. Penyedia layanan dapat tetap memerlukan QC penerimaan atau pemeriksaan tambahan sesuai produk dan kondisi sampel.